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生信宝典自开通以来，就致力于写最简单的文字教程，最直观整洁的排版方式，力求提供舒适的阅读体验，力求保证认真看完就可以操作。系列教程，最好从头开始看。从朋友们的关注量、阅读量来看，在一定程度上我们的努力是有效果的。我们秉承在友军公众号可以看到的知识点，如果我们觉得没有需要补充完善的或者写不出新的视角，就采用引用的方式直接附在一组推送里面，减少重复劳动。

但毕竟知识是复杂的，环境是多样的，背景是不同的，学习是需要投入和成本的，所以也会有一些反馈，某些地方没有说清楚。虽然有一些是动动手查一查或多读几遍、多试一下就可以解决的，但每次反馈，都会让给已有的文档一次更新的机会，让它们变得更易懂，越来越完善。也希望大家能多多反馈。

东西越来越多，有些就不是几句话、几段文字可以说清楚的；尤其是操作类的东西，如果详细记述可能需要耗费太多文字，还有可能越说越不清楚；大片段的文字不要说学习，估计看都不想看了，所以还是利用下多图、动图和视频会更好一些。

多图系列

插播一下，有些操作类的内容，虽然没有录制视频，但几乎也是一步步截图出来的。绘图系列脚本和Linux学习系列，无论是否录制估计都差别不大，对着文章敲不出来的，录了视频，估计也没效果。

多图文章如下所示，包括海哥和永鑫的傻瓜系列，癌症数据库的使用，分子对接，Cytoscape的使用等。

  1. NGS基础 - 参考基因组和基因注释文件
  2. 生信宝典之傻瓜式 (一) 如何提取指定位置的基因组序列
  3. 生信宝典之傻瓜式 (二) 如何快速查找指定基因的调控网络
  4. 生信宝典之傻瓜式 (三) 我的基因在哪里发光 - 如何查找基因在发表研究中的表达
  5. ICGC数据库使用
  6. TCGA数据库在线使用
  7. 生信软件系列 - NCBI使用
  8. 来一场蛋白和小分子的风花雪月。这个本来应该录制视频的，尤其是可视化部分。但后来写了代码简化了操作，一个命令就可以获得可视化效果，也就省去了操作过程。
  9. Cytoscape之操作界面介绍。小慧慧倾力打造的入门教程，截图呈现Cytoscape的基本界面。

动图系列

刚入门一个语言时，视频看下别人在什么地方下手写代码、如何运行代码是必要的。有图有真相，比怎么描述都更清晰。如果有倾慕你的师兄或师姐，Face to face的教一下更好了。

  1. R语言学习 - 入门环境Rstudio。这是第一篇动图文章，示例了Rstudio中的操作，方便R入门实践，是为后续的绘图文章服务的。

  2. 不用Linux也可以的强大文本处理方法。这一篇本来用的动图，但上传总是失败，在最后关头又改成了截图。写一篇文章也不容易，除了构思、写作，还要面对腾讯的限制。点击原文可以看动图。

无声视频系列

无声视频，部分有字幕。

  1. Python解析psiBlast输出的JSON文件结果。较早前录制的无声视频，主要展示了如何一步步解析JSON文件，也是python学习探索的一个小例子，适合读过并实践过 Python学习极简教程 （一） 系列文章 (共6篇，包含较多的生信相关练习题，入门Python的好帮手)有一定基础后观看。

  2. Cytoscape教程1。最早推出的Cytoscape教程，没有声音应该不是最大的槽点，因为附有详细的字幕。但视频质量不高，使得经常被吐槽。但内容还是不错的，无论是基础操作，还是网络绘制，KEGG通路图绘制，涉及的内容比后期推出的教程更多。这也是秉承不重复造轮子的后遗症，之前写过的做过的不想重复来重复去，每次都得搞点新意。

  3. 新出炉的Cytoscape视频教程。最新推出的Cytoscape教程，无声但是高清。除了弥补之前视频质量低的遗憾，更重要的是最近提供的服务中网络图绘制比较多。不断的操作又有了新的体会，两份教程最好互补着看。对自己的声音没自信，导致又出现了个视频半成品。以后有了新的操作心得，整合之前的都重新录制下。声音好的也欢迎跟我们联系，一起录制。

有声视频

  1. UCSC XENA - 集大成者(TCGA, ICGC)。这个视频是舶来品，官方网站提供到YouTube的视频。下载下来传到腾讯视频，避免了一些访问不了的操作。看完这个视频对UCSC XENA的操作一目了然，也让我意识到视频的巨大威力。应该对我们设计实施的网站或提供的结题报告，也都来一个视频教程，更清晰，更体贴。

  2. 教师节献礼 - 文章用图的修改和排版。这是第一个公开的视频教程，录完也没敢仔细听，怕没自信继续录了。上学时，录制过一个无声的操作视频，EXE格式，今天也看了下，也还挺不错的，内容比这个更多，选个黄道吉日也整理下分享出来。 在看过有声视频后，熟悉了操作；再看之前的无声视频，互补一下。

纪录片系列

这是友军公众号“宏基因组”提供的每周一部纪录片系列，都是很不错的片子。

  1. 日本NHK的《生命大跃进》。讲述了通过高通量测序(NGS)等一系列技术研究近四十亿年间的生命进化历程。日剧女神新垣结衣也有加盟，剧中一人分饰姐妹两角。特效堪比《权力的游戏》，主演相当国内当红的-赵立颖，感觉值得学习一下。

  2. 英国BBC的《人体奥秘》。有史以来第一次以如此清晰的方式，目睹胚胎在一个月到十星期过程中的面部形成过程，——直到这个过程结束胚胎的体积也还只有一颗菜豆那么大。不过，更令人震惊的或许是影片本身——在子宫中，人类的“变形”并不比什么科幻动画与电影作品中的机器人来得平淡。

  3. 中国CCTV9的《法医密档》。除了“死亡时间”之外，还有如何确定“死者身份”、如何通过一滴干枯的血迹寻找凶手等等。节目在破解案件的同时，也在传递法医“为死者代言，为生者谋权”的职业精神。

  4. 从生到死的全部秘密—人体内旅行 inside the living body。制作人员采用显微摄影技术、先进的医学技术和心脏断层(CT)显像技术，展现了从幼年、青年、成年到老年过程中，人体是如何运作、成长和成熟的。这是人一生从外部到内部的旅程，探讨了感官及其运作，大脑发育、消化系统、血液循环、细胞分裂、骨质的硬化和更换、身体死亡，等等。灵活的摄像机追踪了食物的消化过程(从嘴巴进入食道、胃、小肠、大肠、肛门)，以及血液循环系统(从心脏到静脉、微血管)和脂肪在腹部与肠道的聚集。还包括人生的许多选择，如锻炼、喝酒、抽烟、听嘈杂音乐、压力等是如何影响我们身体的功能和健康的。

生信宝典，换个角度学生信

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