问题来源
这个问题最初是在实验室的老人们毕业时出现的，毕业论文写好了，交到导师那，被打回来，杂志名字的缩写不统一，有简写，有全称，简写有的加点了，有的没加。然后就是一顿核对、修改，怪自己太相信Endnote了。老人们毕业了后，千叮咛，万嘱咐，这个一定要注意，改着累眼。后来在看合作者的文章时，也确实发现了这一问题的普遍存在。
想想Endnote应该不能这么弱智吧，向来都用这个工具，怎么就冷不丁出了问题。
于是依靠万能的谷歌，开始搜索，在根据搜索获得的内容，不停替换关键字，最后找到了原因和解决方案，并实践做了修改和补充，记录如下。
Endnote在获取参考文献时由于来源不同，有时我们会用PubMed，有时在官网导入，或从PDF直接导入，最后捕获的杂志名称格式也不同，有时为全称，有时为不加点的缩写，有时为加点的缩写。虽然Endnote的output style可以设置使用什么格式的杂志名字。但因为输入时的名字的不匹配，使得Endnote无法完成转换，最后输出的只能是原始存入的名字，这在插入引用时就造成了麻烦，使得论文中参考文献来源的杂志名字不统一。而这一点，不能单纯的通过修改Endnote-output style来解决。而是需要整理一个杂志名字对照表，保证任何存入的名字，不管什么古怪的格式，都能索引到它的正式的名字，这样就可以通过在output style中选择全名、加点的缩写、不加点的缩写来实现杂志名字的统一配置。
配置方案
-
下载杂志的名字及其缩写表 （https://www.library.uq.edu.au/faqs/endnote/medical_2010.txt）
-
将
medical_2010.txt的文字复制为两份，第二份中用第3列替换第一列，然后合并到原文件。Endnote会利用第一列的杂志名去跟其自动获取的杂志名字去匹配(也就是说第一列是索引列，任何稀奇古怪的杂志名字在第一列都得有匹配，才能保证引用正确)，从而关联上这些杂志名字的全名和缩写名（文件的2,3,4列）。因为前面提到Endnote获取杂志名时有时是全名，有时是缩写，因此索引列要包含的不同类型的名字足够多，这也就是这一步操作的目的 -
或者跳过前两步使用我整理的名字和缩写表 (下载地址 https://pan.baidu.com/s/1slmGv1r)
-
若
medical_2010.txt没收录你关注的杂志，可自行添加，具体见补充方案。（杂志缩写加点的原则是：缩写词后加点，非缩写词不加点） -
打开
endnote-tools-open term lists-journal term list，在打开的对话框中选择journals并且点击Delete List -
然后点击
create list，在弹出框中输入Journals(注意大小写)，勾选单选框(Journal list)，点击OK -
点击
Import List—选择刚才修改过的medial_2010.txt—导入 -
防止自动更新：菜单
edit-Preferences-Term Lists- 不选择Update list when importing or pasting references -
更新文献，一切安好，获得晴天
补充方案
假如在Endnote中你收录了一个文献没有包含在我们之前导入的文件中，它的Journal项名字为 Hootie and the Blowfish，它对应的缩写为Hoo and the Blow。那么你需要在medical_2010.txt中添加如下行，然后再次重复上述导入操作：
Hootie and the Blowfish Hoo. and the Blow. Hoo and the Blow Hootie and the Blowfish
这四列分别表示 索引列，杂志带点缩写列，杂志无点缩写列，杂志全称列。Endnote会拿其收录文献的Journal项的名字去我们导入的这个文件 的第一列去匹配，这也是为什么我们使用Journal项的名字作为第一列，然后去提取对应的杂志缩写列和全称列。
生信宝典，生物信息学习系列教程，转录组，宏基因组，外显子组，R作图，Python学习，Cytoscape视频教程
http://mp.weixin.qq.com/s/d1KCETQZ88yaOLGwAtpWYg